その5です。今回は第4章の章末問題に取り組んでいきます。 4章 対応ある2群の差と相関の推測 内容 対応ある2群のt検定のオルタナとして機能します 対応ある、の意味とは？ 同じ観察対象から2回測定しているもの beforeの体重とafterの体重のセット * n個など…

対応のあるt検定を行う前に、3章の内容を等分散モデルで書くとどうなるか、をちゃんと検証します。 番外編 3章の等分散モデルと変分ベイズによる推定 等分散モデルによる差の推定 といっても、Stanのモデルをちょっと変えるだけなのでした。 まずコンパイル …

その4です。今回は第3章の話をしていきます。 3章 独立した2群の差の推測 内容 2群に分けた群比較をする際には、ランダム化による交絡因子の排除が重要！(ランダマイゼーション) 2群の、どんな差を見たいかで仮説は変わる 群1の平均が群2の平均を上回る確率 …

その3です。今回は第2章の話をしていきます。 2章 MCMCと正規分布の推測 内容 解析的に事後分布を推定するのは難しい! ベイズの定理を利用しても、分母に位置する正則化定数の積分が複雑で解析的に解けない 事後分布に従う乱数を発生させる、という発想転換…

前置き 環境構築 まずPythonを実行する環境を作ります。 一応メモとして書きますが、他にもPythonの導入の記事はたくさんありますので、そちらも参考ください。 以下のものはOSXを想定しています。 自分は基本的にはpyenv + pyenv-virtualenvを利用していま…

このブログの開設目的の、 はじめての 統計データ分析 ―ベイズ的〈ポストp値時代〉の統計学―作者: 豊田秀樹出版社/メーカー: 朝倉書店発売日: 2016/06/02メディア: 単行本（ソフトカバー）この商品を含むブログ (11件) を見る についての記事インデックスで…

自己紹介 ブログ始めました。 普段は次世代シーケンサー(NGS)を用いた遺伝統計学や、ゲノム配列から得られる知見の解析、それらのツール・DB開発などを行っています。 ブログの目的 自身で勉強したことを内部のWikiに書いていたのですが、もっと外部に公開し…